Отдел лечебно-профилактической помощи осуществляет:
•диспансеризацию и лечение ВИЧ-инфицированных и больных СПИД;
•обеспечение ВИЧ-инфицированных и больных СПИД антиретровирусными препаратами;
•проведение комплекса мероприятий по предоставлению профилактического противовирусного лечения ВИЧ-инфицированным беременным женщинам во время беременности, в родах и новорожденным;
•обеспечение химиопрофилактикой вторичных, оппортунистических (пневмоцистной пневмонии и токсоплазмоза) заболеваний у взрослых и детей с ВИЧ-инфекцией и лечением оппортунистических заболеваний (пневмоцистная пневмония, герпетическая инфекция, токсоплазмоз и кандидоз) в амбулаторных условиях; 
•психосоциальное консультирование до и после тестирования на ВИЧ;
•обеспечение доступа населения к постконтактной антиретровирусной профилактике;
•оценка доступности услуг психосоциального консультирования и тестирования (в том числе анонимно);
•оказание консультативной помощи ВИЧ-инфицированным и больным СПИД по правовым и социальным вопросам;
•оказание консультативной, практической помощи медицинским организациям и медицинским службам ведомств.
Заведующая отделом – врач высшей квалификационной категории Нургожина Гульнар Серикқызы, телефон отдела 38-04-64