Деятельность отдел профилактической работы направлена на: 
- организацию, проведение профилактических мероприятий, направленных на предупреждение распространения ВИЧ-инфекции на территории г. Астаны, среди   ключевых групп населения, уязвимых к ВИЧ и населения в целом;
- оказание консультативной, практической и организационно-методической помощи медицинским организациям занимающимися трансфузией (трансплантацией) донорского биоматериала, УКУИС, ДВД,УО;
- оценка эффективности мероприятий, проводимых медицинскими организациями занимающимися трансфузией (трансплантацией) донорского биоматериала, по предотвращению передачи ВИЧ; 
- организация медицинского обследования на наличие ВИЧ-инфекции медицинскими организациями занимающимися трансфузией (трансплантацией) донорского биоматериала в соответствии с постановлением ПРК № 1280 от 03.11.2011г.;
- анализ полноты и качества отбора подлежащего контингента для обследования на ВИЧ по клиническим показаниям в медицинских  организациями занимающимися трансфузией (трансплантацией) донорского биоматериала;
- взаимодействие с медицинскими, ведомственными, международными и общественными организациями в проведении профилактических мероприятий, а также подготовке врачей, средних медицинских работников, педагогов, учащихся, родителей, подростков, личного состава воинских подразделений, специального контингента, осужденных, волонтеров и молодежи.;
- участие в разработке профилактических программ по проблеме ВИЧ-инфекции совместно с местными исполнительными органами, органами управления здравоохранения, различными ведомствами и общественными объединениями;
- проведение комплекса мероприятий, направленных на предупреждение и снижение темпов распространения ВИЧ-инфекции;
- организацию деятельности пунктов доверия и дружественных кабинетов в установленном законодательством порядке.
- организацию обучения специалистов различных ведомств, педагогов и учащихся школ, средних и высших учебных заведений;   
- организацию и проведение семинаров для медицинских работников 
- оказание организационно-методической помощи медицинским организациям и медицинским службам ведомств и учебным заведениям Министерства образования и науки Республики Казахстан, Министерству труда и социальной защиты Республики Казахстан;
- мониторинг и оценка эффективности профилактических программ для уязвимых к ВИЧ групп населения;
- мониторинг реализации ГПРЗ РК «Саламатты Казахстан», а также других программ и соглашений, в которых участвует Республика Казахстан.
- информирование населения о путях распространения и методах предупреждения заражения ВИЧ-инфекцией, организация обучения специалистов различных ведомств, проведение санитарно-просветительной работы, издание и распространение информационно-образовательных материалов;
- обучение медицинских работников вопросам профилактики ВИЧ-инфекции;
- участие в проведении второго поколения эпиднадзора за уровнем распространенности ВИЧ-инфекции в дозорных группах, разработка комплекса профилактических мероприятий;
- организация и проведение информационно-образователной работы по вопросам ВИЧ и СПИД среди различных групп населения;
- участие в разработке проектов нормативных правовых актов, инструктивных, методических материалов по организации эпидемиологического надзора за ВИЧ и профилактических мероприятий по ВИЧ и СПИД;
- участие в мероприятиях, посвященных проблемам ВИЧ и СПИД, с привлечением СМИ, организация пресс-конференций, круглых столов, ток –шоу, вечеров вопросов и ответов, подготовка статей;
- участие в разработке и распространении образовательных программ, учебных и наглядных пособий, информационных материалов для различных групп населения;
- организация деятельности пунктов доверия в установленном законодательством порядке;
- организация деятельности дружественных кабинетов в установленном законодательством порядке;
Заведующий отделом профилактики - Мухамедиев Алмас Муратбекович, телефон отдела 27-95-04